Fakultas Ekonomi dan Bisnis UMM memiliki struktur organisasi yang dirancang untuk menjamin terselenggaranya tata kelola akademik dan administrasi yang efektif, transparan, serta berorientasi pada mutu. Struktur ini mencerminkan pembagian peran dan tanggung jawab yang jelas antara pimpinan fakultas, unit akademik, serta unsur pendukung lainnya dalam mendukung pelaksanaan pendidikan, penelitian, dan pengabdian kepada masyarakat. Melalui sinergi antar unsur organisasi, Fakultas Ekonomi dan Bisnis UMM berkomitmen untuk menciptakan lingkungan akademik yang profesional, inovatif, dan berdaya saing.